يُعد شهري أغسطس ويوليو عادةً الأكثر سخونة بمتوسط درجة حرارة يبلغ 12 من درجات الفهرنهايت، بينما يُعد كل من شهري يوليو وأغسطس الأكثر برودة بمتوسط درجة حرارة يبلغ 12 من درجات الفهرنهايت. تُعد أشهر مارس، ويناير، وديسمبر، وفبراير الأكثر هطولًا للأمطار في سان خوان، إذ يشهد كل شهر متوسط هطول أمطار يبلغ 255 من البوصات.
