يُعد شهري مايو وأبريل عادةً الأكثر سخونة بمتوسط درجة حرارة يبلغ 29 من درجات الفهرنهايت، بينما يُعد كل من شهري يناير وفبراير الأكثر برودة بمتوسط درجة حرارة يبلغ 23 من درجات الفهرنهايت. تُعد أشهر سبتمبر، وأكتوبر، ويونيو، وأغسطس الأكثر هطولًا للأمطار في ناكاخوكا، إذ يشهد كل شهر متوسط هطول أمطار يبلغ 288 من البوصات.
